Akademický ústav, který je součástí Akademie věd České republiky. Vznikl 1. ledna 2006 připojením Masarykova ústavu AV ČR k Archivu AV ČR. Více o historii obou institucí.
Masarykův ústav a Archiv AV ČR rovněž na základě smlouvy s Ústavem T. G. Masaryka spravuje Archiv Ústavu T. G. Masaryka a knihovnu Ústavu T. G. Masaryka. V letech 2015-2016 byly adaptovány nové prostory pro knihovnu T. G. Masaryka. S podporou Vlády ČR započala v roce 2017 katalogizace celého knihovního fondu.